2000
11월 4일
2000년 대희년·안중근 의거 91주년 기념 심포지엄 ‘2000년 대희년과 안중근 토마스’-한국교회사연구소 주최, 안중근 학교·안중근 의사 연구현양회 후원
기조강연 21세기 통일 한국인상과 안중근 / 안충석 신부, 천주교정의구현전국사제단 고문
제1 주제 안중근의 천주교 신앙과 사상 / 차기진 박사, 양업교회사연구소 소장
제2 주제 안중근의 대일본 인식과 하얼빈 의거 / 장석흥, 국민대학교 교수
제3 주제 안중근 토마스의 신앙과 덕행 / 전달수 신부, 안동 다인 본당
제4 주제 안중근 의사의 신앙과 윤리 / 정인상 신부, 인천 가톨릭대학교
제5 주제 안중근의 신앙과 현양에 대한 비교사적 검토 / 변기찬, 부산 외국어대학교 교수
2001
5월 19일
한국교회사연구소·한국종교문화연구소 공동 심포지엄 ‘한국 근대 종교 문화와 천주교’-한국교회사연구소·한국종교문화연구소 공동 주최
제1 주제 개항기 천주교와 근대성 / 장석만, 한국종교문화연구소 연구실장
제2 주제 한말 천주교와 동학-천도교 / 고건호, 한국종교문화연구소 연구위원
제3 주제 한말 천주교와 제주 교안 / 방상근, 연구소 연구사
제4 주제 일제하 천주교와 사회주의의 상호 인식 / 이진구, 한국종교문화연구소 연구위원
9월 29일
신유박해 200주년 교회사 국제 심포지엄 ‘동아시아 천주교의 수용과 박해’-한국교회사연구소 주최
발제강연 가톨릭 신앙의 東漸과 동아시아 전통 사회 / 이원순, 서울대학교 명예교수·연구소 고문
제1 주제 일본에서의 기리시탄 박해의 역사성 / 고노이 다카시, 일본 동경대학교 교수
제2 주제 淸初 대천주교 정책의 변천 / 구웨이민, 중국 화동사범대학교 교수
제3 주제 신유박해의 배경과 성격 / 서종태, 연구소 책임연구원
2002
9월 28일
2002년도 한국교회사연구소 심포지엄 ‘한국 천주교회와 여성’-한국교회사연구소 주최, 명동 성당 후원
기조강연 교회와 여성 / 김성태 신부, 연구소 소장
제1 주제 초기 교회 여성 신자들의 신앙생활과 활동 / 김정숙, 영남대학교 교수
제2 주제 병인박해기 여성 신자 연구 / 방상근, 연구소 연구사
제3 주제 일제 시기 천주교회의 여성 인식과 여성 교육 / 신영숙, 서울여자대학교
제4 주제 현대 천주교회의 여성 활동과 그 전망 / 최혜영 수녀, 가톨릭대학교
2003
3월 29일
양화나루·잠두봉 사적지 지정 5주년 기념 심포지엄 ‘양화나루·잠두봉 유적의 종합적 고찰’-한국교회사연구소 주관, 절두산 순교성지 주최, 한국순교자현양회, 명동 성당 후원
기조강연 교회 사적·교회 문화재 보전의 참뜻을 생각하며 / 이원순, 서울대학교 명예교수·연구소 고문
제1 주제 楊花津 일원의 역사 지리적 고찰 / 최영준, 고려대학교 교수
제2 주제 한강 津渡制와 楊花津 / 최완기, 이화여자대학교 교수
제3 주제 한강 鎭堡 체제와 楊花鎭 / 강석화, 경인교육대학교 교수
제4 주제 近代史上의 楊花津 / 최기영, 연구소 연구실장
제5 주제 병인박해와 切頭山 순교자들 / 서종태, 연구소 책임연구원
제6 주제 마포 지역 가톨릭 성장사 / 방상근, 연구소 연구사
2004
9월 11일
연구소 설립 40주년 기념 심포지엄 ‘교회사 연구, 어떻게 할 것인가?’-한국교회사연구소 주최, 서울대교구 명동 성당 후원
기조강연 교회사 연구와 교회사 서술의 문제 / 최석우 신부, 연구소 명예소장
제1 주제 교회사는 신학인가? / 황치헌 신부, 수원교구 송전 본당
제2 주제 역사학 관점에서 본 한국 천주교회사 서술 / 박찬식, 제주대학교
제3 주제 교회사와 종교학의 만남, 그 인문학적 전망 / 김윤성, 한신대학교
제4 주제 한국 개신교사 연구의 경향과 과제 / 서정민, 연세대학교 교수
2005
9월 24일
2005년도 심포지엄 ‘제2차 바티칸 공의회와 한국 천주교회’-한국교회사연구소, 가톨릭대학교 신학대학 주최
기조강연 공의회 개념의 문제 / 최석우 신부, 연구소 명예소장
제1 주제 한국 교회의 사회 참여와 제2차 바티칸 공의회 / 강인철, 한신대학교 교수
제2 주제 교구의 최고 권력과 분배 / 박희중 신부, 인천교구 성소국장
제3 주제 평신도의 교회 생활 참여와 제2차 바티칸 공의회 / 한홍순, 한국외국어대학교 교수
제4 주제 제2차 바티칸 공의회와 한국 천주교회의 전례 토착화 / 김종수 신부, 가톨릭대학교 교수
제5 주제 한국 교회의 전통 종교 이해와 제2차 바티칸 공의회 / 황종렬, 미래사목연구소 복음화연구위원장
2006
9월 23일
2006년도 심포지엄 ‘한불관계사의 성찰과 한국 천주교회’
제1 주제 조·불관계 100년사 일고-한국 교회사와 연관하여 / 이원순, 서울대학교 명예교수
제2 주제 조불조약이 초기 개신교의 선교활동에 미친 영향 / 이진구, 호남신학대학교 교수
제3 주제 한말 교안과 교민조약-교회와 국가의 관계를 중심으로 / 박찬식, 제주대학교 교수
제4 주제 구한말의 주한 프랑스인 사회-《뮈텔 주교 일기》를 중심으로 / 최종고, 서울대학교 교수
2007
10월 20일
심포지엄 ‘한말·일제 강점기 선교회의 한국 진출과 천주교’-한국교회사연구소 주최
기조강연 / 염수정 주교, 연구소 재단 이사장
제1 주제 파리 외방전교회와 조선대목구의 분할 / 조현범, 연구소 책임연구원
제2 주제 ‘선교 베네딕도회’의 한국 진출과 선교 활동-일제 시대 한국과 만주에서의 활동을 중심으로 / 선지훈 신부, 성 베네딕도회 왜관 수도원
제3 주제 1930년대 메리놀 외방전교회의 선교 활동 / 김수태, 충남대학교 교수
제4 주제 머나먼 동쪽을 찾아온 선교사들-1945년 해방가지 광주교구의 골롬반 선교회 / 옥현진 신부, 광주 가톨릭대학교
2008
8월 29일
2008년도 심포지엄 ‘경기 북부 지역과 한국 천주교’-의정부교구 순교자공경위원회 주최, 한국교회사연구소 주관
제1 주제 초기 교회시대 경기 북부 지역의 천주교-경기도 마재와 나주 정씨 가문을 중심으로 / 차기진, 양업교회사연구소 소장
제2 주제 박해 시기 경기 북부 지역의 천주교 / 방상근, 세종대학교
제3 주제 개화기·일제 강점기 경기 북부 지역의 천주교-본당 및 공소와 신자 수 변화를 중심으로 / 양인성, 연구소 연구원
제4 주제 경기 북부 지역 敎會 史蹟에 관한 기초적 검토-黃嗣永 墓所를 중심으로 / 이장우, 연구소 연구실장
2009
9월 11~12일
2009년도 심포지엄 ‘성 베네딕도회의 한국 선교와 문화 활동’
성 베네딕도회 왜관 수도원 주최, 한국교회사연구소 주관
첫째 날(2009년 9월 11일)
제1 주제 ”Wie meine Mutter den Sauerteig ben tzt hat“ Benediktiner als Missionare in Korea und Nordostchina 1909~1954 / Dr. Johannes Mahr, 독일 뷔르츠부르크 대학교 교수
제2 주제 왜관 수도원의 수도 생활과 선교 활동 / 선지훈 신부, 성 베네딕도회 왜관 수도원
제3 주제 한국 교회 전례 쇄신을 위한 베네딕도회의 기여-발간된 전례서를 중심으로 / 인영균 신부, 성 베네딕도회 왜관 수도원
제4 주제 분도회 선교사들의 한국 문화 연구 / 조현범, 연구소 책임연구원
제5 주제 분도회가 간행한 성가집-전례운동과 토착화 과정을 중심으로 / 최호영 신부, 가톨릭대학교 교수
둘째 날(2009년 9월 12일)
제6 주제 식민지 조선에서 분도회의 지식 생산과 교육 / 이유재, 독일 본 대학교
제7 주제 분도출판사의 도서 간행 / 김수태, 충남대학교 교수
제8 주제 1930년대 연길교구의 《가톨릭少年》 발간에 관한 일고찰 / 최기영, 서강대학교 교수
제9 주제 분도회 출신 순교자 연구-시복·시성 대상 인물 분석 / 장정란, 가톨릭대학교
제10주제 분도회와 한국 근대 건축 / 김정신, 단국대학교 교수